Najważniejszym elementem każdego rekuperatora są wymienniki, czyli części odpowiedzialne za fizyczny transfer ciepła z powietrza zużytego, usuwanego z obiektu do powietrza świeżego, pompowanego do wnętrza. Wymienniki mogą chłodzić albo ogrzewać powietrze w zależności od ustawień, pory roku i wymagań użytkownika.
Ze względu na budowę wyróżnia się trzy rodzaje tych elementów:
Za najmniej wydajne uważa się wymienniki krzyżowe, których sprawność dochodzi do 60 proc., ale jeśli połączymy w sposób szeregowy dwa urządzenia, efektywność takiego miniukładu wzrośnie do 80 proc. Wadą tego rodzaju wymienników jest brak odporności na szron, który osadza się na powierzchni płyt już przy temperaturze minus 5 st. C. Można temu zapobiec, zmniejszając za pomocą obejścia (by-passu) ilość świeżego powietrza przechodzącego przez wymiennik.
Wymienniki przeciwprądowe są skuteczniejsze, bo ich sprawność ocenia się na 85 proc. Poza tym są odporne na szronienie. Z tych powodów są najczęściej wybieranym rozwiązaniem w zakresie rekuperacji w domach jednorodzinnych. W większych obiektach stawia się na wymienniki obrotowe, które uchodzą za najbardziej sprawne (90-proc. wydajność), a do tego pozwalają odzyskać wilgoć do nawilżania suchego zimowego powietrza z zewnątrz.